Laboratorio di Citogenomica e Citogenetica molecolare

 

Nel Laboratorio di citogenetica si esegue l'analisi del cariotipo sia in epoca prenatale su villi coriali o liquido amniotico, sia in epoca postnatale su campione di sangue periferico. Si esegue, inoltre, diagnosi citogenetica oncoematologica per la determinazione di anomalie cromosomiche acquisite nelle patologie oncoematologiche. Nell’elenco sotto riportato sono indicate le indagini disponibili presso il laboratorio. L’indagine citogenetica classica (cariotipo) può essere approfondita con le tecniche di Citogenetica molecolare (FISH) e con la tecnologia array-CGH ad alta risoluzione per l'individuazione dei microriarrangiamenti genomici.

Laboratorio di citogenomica:

• analisi classica del cariotipo costituzionale :  in epoca prenatale su villi coriali/ liquido amniotico/tessuti abortivi,  in epoca postnatale su sangue periferico
• analisi classica del cariotipo per anomalie acquisite (citogenetica oncoematologica): eseguita su sangue midollare, serve a determinare la presenza di anomalie cromosomiche acquisite, tuttora di rilevo per la diagnosi e prognosi  delle patologie ematologiche.
• citogenetica molecolare (cariotipo molecolare): tecnologia Array-CGH e FISH.  Lo studio di riarrangiamenti submicroscopici, indispensabili per la diagnosi di pazienti soprattutto pediatrici in presenza di tratti dismorfici , malformazioni, ritardo dello sviluppo/mentale,  è eseguito mediante  Array-CGH che permette di evidenziare sbilanciamenti genomici di piccole dimensione, non detectabili con analisi citogenetica classica. Disponibili indagini FISH per la definizione di particolari riarragiamenti cromosomici anche in campo oncoematologico.

 

Laboratorio di biologia molecolare e biologia molecolare oncoematologica

 

Il Laboratorio di biologia molecolare si occupa della diagnosi molecolare di patologie genetiche, utilizzando metodiche qualitative e quantitative innovative su campioni di sangue. Tali analisi comprendono sia mutazioni costituzionali che somatiche (acquisite) responsabili di patologie oncoematologiche .Vengono inoltre eseguite analisi di predisposizione genetica per malattia multifattoriali (trombofilia ereditaria) e di farmacogenetica.

Analisi  costituzionali eseguite:

• Screening Fibosi cistica (I° livello  determinazione di 77 mutazioni)
• Fattori della coagulazione  (mutazioni fattori V e II)
• Mutazioni MTHFR
• Mutazioni del gene connessina 26,30 e mutazioni  mitocondriali
• Test di metilazione (Analisi per la S. di Prader Willi-Angelman)
• Microdelezioni cromosoma Y : infertilità maschile
• Mutazioni gene HFE (Emocromatosi)
• Sequenziamento gene Beta- talassemia
• Sequenziamento gene SHOX
• Sequenziamento Sanger di varianti familiari note.
• Analisi farmacogenetiche (tossiticità al 5’Fluorouracile e Iirinotecan): test molecolare sui geni DPYD e UGT1A1.
• NGS  (Next Generation Sequencing)  Esoma clinico. L’introduzione della tecnologia di sequenziamento di ultima generazione  trova applicazione in tutti quei casi in cui la conoscenza più approfondita del genoma può portare al corretto inquadramento della patologia – e quindi della cura – oppure a valutazioni predittive in merito a possibile ricadute ereditarie della patologia ovvero varianti riguardanti la patologia. L’uso di software di bioinformatica  avanzati permettono di priorizzare le varianti informaticamente, mediante algoritmi altamente standardizzati, consentendo la creazione di pannelli virtuali e customizzabili, in base alle richieste/esigenze dei clinici. E’ prevista a breve introduzione del Whole Exome Sequencing (WES)

 

Analisi per anomalie acquisite (indagini oncoematologiche) :

Le competenze di biologia molecolare e la stretta collaborazione che negli anni si è sviluppata con l’U.O.C. di Ematologia hanno permesso alla SSD di Genetica di emergere come laboratorio di eccellenza nella diagnostica oncoematologica. Le indagini eseguite riguardano la determinazione delle varianti e  riarrangiamenti molecolari per la diagnosi di :

• Sindromi Mielodisplastiche
• Leucemie Mieloidi Acute
• Leucemie Mielodi Croniche
• Policitemia Vera,  Mielofibrosi Idiopatica, Trombocitemia Essenziale
• Test NGS in oncoematologia : pannello di circa 40 geni dedicato all’oncoematologia,