Il Servizio è certificato ISO 9001-2000 dal 2002(ente certificatore IQNet).

Il Servizio è sede di attività formative dei Medici della Scuola di Specializzazione in Anatomia Patologica, degli studenti Corsi di Laurea in Medicina e Chirurgia, Odontoiatria e Protesi Dentaria, Biologia, e del Corso di Laurea per Tecnico di Laboratorio Biomedico.

Le attività diagnostiche svolte nel Servizio di Anatomia Patologica sono improntate ad una metodologia di lavoro clinicamente orientata ed i Medici operano in équipe, occupandosi di diversi settori specialistici della patologia, quali:

• patologia dell'apparato gastro-enterico
• patologia della mammella
• patologia degli organi endocrini
• patologia dell'apparato respiratorio
• patologia del fegato
• patologia dell'apparato genitale femminile
• patologia del sistema dell'apparato urologico e genitale maschile
• patologia renale
• patologia degli organi emopoietici (linfonodi, milza e midollo osseo)
• patologia degli organi e tessuti del cavo orale, della regione maxillo-facciale e otorinolaringoiatrica
• patologia del tessuto nervoso centrale e periferico
• patologia della cute e dei tessuti molli superficiali e profondi

Annualmente vengono eseguiti circa 60.000 esami per pazienti degenti nelle Divisioni di Diagnosi e Cura e/o in regime di Day Hospital e per pazienti ambulatoriali e/o gestiti da altri Presidi Sanitari pubblici e privati.

Il Servizio svolge inoltre attività diagnostica di consulenza (second opinion) su preparati allestiti presso altri Istituti.

Il Servizio è coinvolto nello screening del carcinoma della mammella (in collaborazione con ASL di Varese e con il Centro di Senologia e con la S.S. di Diagnostica senologica), nelloscreening del carcinoma del colon-retto (in collaborazione con ASL di Varese e con la divisione di Gastroenterologia) e nella prevenzione del carcinoma della cervice uterina.